Ябълковия оцет се ползва главно, заради съдържащият се в него пектин. Ползите от пектина са много, особено за хората с нарушена обмяна на веществата. Той намалява нивото на лошия холестерол, без обаче да влияе на нивата на добрия  в организма. Пектинът понижава и нивото на кръвната захар, след прием на въглехидрати, което го прави и полезен за хората с диабет.
Той подобрява функциите на дебелото черво, като разрежда неговото съдържание и способства изхвърлянето на вредните токсични вещества, които се отделят, след преработка на храната.

Пектинът забавя процесите на храносмилане и така създава усещане за ситост по-дълго време, което помага да намалим количеството на приетата храна, когато го ползваме за отслабване. Той е чудесен помощник в борбата със затлъстяването, а освен това помага и при сърдечно съдови болести, диабет,  жлъчно – каменна болест, ставни и кожни заболявания и разширени вени. Не се препоръчва на хора със стомашни проблеми, тъй като най-добри свойства има, когато се приема на гладно.

Пектин има в плодовете, като по-големи количества съдържат ябълките, дюлите и цитрусувите плодове.  С половин килограм плодове, обаче могат да се премат само 0.5гр. пектин, затова е необходимо да го приемаме и под формата на хранителни добавки.

Ябълковия оцет има и много външни приложения. С него може да се прави баня на стъпалата при гъбички мъжду пръстите, като разтворът е в съотношение 1:1.Добре известни са и ползите от него в козметиката, тъй като помага в борбата с косопада, пърхота и акнето. Добро средство е и срещу ухапване от насекоми и спира сърбежа при кожни раздразнения.